MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium cellulolyticum H10 chromosome

Total Repeats: 13914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011898	A	7	7	1447	1453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011898	CAG	2	6	1480	1485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011898	CTA	3	9	1538	1546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011898	TTA	2	6	1547	1552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011898	TA	3	6	1560	1565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011898	TAA	2	6	1577	1582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011898	TTA	2	6	4096	4101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011898	GGA	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011898	TTG	2	6	4415	4420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011898	TAT	2	6	6373	6378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011898	A	6	6	6379	6384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011898	GAG	2	6	6385	6390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011898	TA	3	6	6391	6396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011898	T	7	7	6401	6407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011898	TAT	2	6	6514	6519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011898	TAT	2	6	6528	6533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011898	TAA	2	6	6609	6614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011898	T	7	7	8295	8301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011898	TAAT	2	8	8958	8965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011898	TATT	2	8	9774	9781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011898	TAT	3	9	9799	9807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011898	A	6	6	9830	9835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011898	TAAAA	2	10	9842	9851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011898	GA	3	6	9877	9882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011898	CT	3	6	9955	9960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011898	AAAT	2	8	9966	9973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011898	CTT	2	6	10085	10090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011898	ACA	2	6	10148	10153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011898	TTA	2	6	10294	10299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011898	TAA	2	6	10309	10314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011898	A	7	7	10356	10362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011898	ATT	3	9	10370	10378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011898	AAT	2	6	10397	10402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011898	ATT	2	6	10967	10972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011898	A	6	6	11001	11006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011898	AAT	2	6	11011	11016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011898	AT	4	8	11020	11027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011898	AT	3	6	11036	11041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011898	TAAT	2	8	11051	11058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011898	TAA	2	6	11078	11083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011898	TAT	2	6	11097	11102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011898	ATT	2	6	11133	11138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011898	ATA	2	6	11144	11149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011898	GGAT	2	8	11158	11165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011898	A	6	6	11842	11847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011898	ACT	2	6	11852	11857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011898	TAT	2	6	12444	12449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011898	T	6	6	12795	12800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011898	T	6	6	12802	12807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011898	TAAT	2	8	12827	12834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011898	AT	3	6	12833	12838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011898	GGT	2	6	12871	12876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011898	TAAA	2	8	13083	13090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011898	ATT	2	6	13102	13107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011898	TTA	2	6	13165	13170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011898	TGC	2	6	13184	13189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011898	ATT	2	6	13192	13197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011898	TGT	2	6	13224	13229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011898	AACAA	2	10	13238	13247	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011898	A	7	7	13274	13280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011898	TTA	2	6	13313	13318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011898	AGG	2	6	13319	13324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011898	A	6	6	16894	16899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011898	T	7	7	16938	16944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011898	ATA	2	6	16996	17001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011898	CTA	2	6	17016	17021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011898	AAAT	2	8	17055	17062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011898	A	7	7	17077	17083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011898	TTA	2	6	17171	17176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011898	A	6	6	17215	17220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011898	GGCC	2	8	18257	18264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011898	TTA	2	6	19984	19989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011898	ATCT	2	8	20011	20018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011898	TAA	2	6	20028	20033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011898	TA	3	6	20055	20060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011898	A	7	7	20129	20135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011898	TA	3	6	20136	20141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011898	TAT	2	6	20165	20170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011898	TAA	2	6	20176	20181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011898	TTAT	2	8	20182	20189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011898	AT	3	6	20188	20193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011898	AAT	2	6	20221	20226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011898	TA	3	6	20470	20475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011898	A	6	6	20477	20482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011898	AT	3	6	20513	20518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011898	TAA	2	6	20549	20554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011898	TGA	3	9	20562	20570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011898	TTA	2	6	20869	20874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011898	TAA	2	6	20911	20916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011898	AACAA	2	10	20920	20929	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011898	ATT	2	6	20971	20976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011898	CATAA	2	10	21022	21031	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011898	A	6	6	21030	21035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011898	TA	3	6	21036	21041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011898	GTT	2	6	21056	21061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011898	TGA	2	6	21073	21078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011898	AT	3	6	22689	22694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011898	TATT	2	8	22763	22770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011898	T	6	6	22769	22774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011898	TAATT	2	10	22776	22785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011898	TA	3	6	22845	22850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011898	TAAA	2	8	22858	22865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011898	T	6	6	24461	24466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011898	TA	3	6	24468	24473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011898	TA	3	6	24493	24498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011898	ATA	2	6	26122	26127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011898	TAAA	2	8	26140	26147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011898	TAT	2	6	26168	26173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011898	ATTTT	2	10	26205	26214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011898	TAG	2	6	26219	26224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011898	TA	3	6	26238	26243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011898	AGG	2	6	26250	26255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011898	AAT	2	6	27517	27522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011898	T	6	6	27522	27527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011898	GCA	2	6	30036	30041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011898	TTG	2	6	30050	30055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011898	TTAA	2	8	31999	32006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011898	GGT	2	6	32009	32014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011898	A	7	7	35615	35621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011898	ATTA	2	8	35642	35649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011898	TTA	2	6	37785	37790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011898	ATA	2	6	37858	37863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011898	AGG	2	6	37891	37896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011898	AT	3	6	40019	40024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011898	ATT	2	6	40134	40139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011898	GTA	2	6	40140	40145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011898	GAA	2	6	40148	40153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011898	GGA	2	6	40616	40621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011898	TAA	2	6	41138	41143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011898	TA	3	6	41144	41149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011898	TA	3	6	41159	41164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011898	GAT	2	6	41180	41185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011898	ATA	2	6	42266	42271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011898	A	8	8	42286	42293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011898	ATA	2	6	42310	42315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011898	ATATT	2	10	42319	42328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011898	AT	3	6	42343	42348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011898	GGA	2	6	42358	42363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011898	AAT	2	6	43393	43398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011898	ATT	2	6	43413	43418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011898	TTAT	2	8	45470	45477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011898	TA	3	6	45478	45483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011898	TAA	2	6	45494	45499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011898	ATTT	2	8	45534	45541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011898	TAA	2	6	45543	45548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011898	ATA	2	6	45582	45587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011898	TA	3	6	45593	45598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011898	TAAAAG	2	12	45610	45621	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011898	AGG	2	6	45650	45655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011898	A	6	6	46194	46199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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